提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
子公司拖累 黑芝麻2022年预亏逾1.2亿元******
中新经纬1月31日电 (闫淑鑫 实习生 赵薇)30日晚,黑芝麻发布公告称,预计2022年归母净利润亏损1.2亿元-1.7亿元,扣非净利润亏损1.1亿元-1.62亿元。
数据显示,2021年,黑芝麻归母净利润也曾亏损1.09亿元。
二级市场上,31日,黑芝麻股价高开1.67%,截至午间收盘报8.67元/股,上涨3.71%,总市值64.5亿元。
提及2022年亏损的原因,黑芝麻在公告中解释称,2022年预计计提商誉减值约1.8亿元-2.1亿元,对整体业绩产生较大影响。
公告显示,2022年,黑芝麻下属全资子公司上海礼多多电子商务有限公司(下称上海礼多多)由于疫情、市场竞争、成本上涨和业务结构调整等多方面不利因素的叠加影响,收入大幅度下降并产生较大亏损,对黑芝麻的整体业绩产生较严重影响。鉴此,公司对收购相关公司所形成的商誉进行了初步评估和测算,并与公司聘请的评估和审计机构进行了初步沟通,拟计提相应的商誉减值准备,预计计提商誉减值金额约1.8亿元-2.1亿元。
黑芝麻称,剔除商誉减值因素,预计公司2022年度实现归母净利润约5000万元-7000万元。
黑芝麻介绍,2022年上半年,疫情对公司的经营造成较大不利影响,尤其是上海礼多多受影响的程度更为严重。公司下半年抓住疫情影响减弱的机会,努力开展各项业务,生产经营活动基本恢复正常,特别是南方黑芝麻糊、黑养黑等主导产品经营取得较好的业绩,较上半年有较大的增长。
数据显示,2022年上半年,黑芝麻实现营收及归母净利润12.96亿元、677.59万元,分别下滑26.61%、42.80%。
黑芝麻曾在半年报中表示,2022年二季度因疫情造成的商超关闭、物流停发等,对公司的销售业务有一定影响,尤其是电商平台经营业务受影响较大,6月初才逐步恢复正常。
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